破案是件精细活儿，急功近利是要不得的。如若不能将真相切实地大白天下，做的再多又有什么意义呢。
第二日，警视厅搜查一课三系继续有条不紊地调查案件。
对于已经死亡的本美佑一、三露知子、四井敏也进行血液检测，发现本美佑一血液中有肌松药成分，四井敏也血液中有镇静药咖啡成分。
最早死亡的本美佑一就如目暮十三推测的那样，被人注射药物扰乱警方视线。四井敏也血液中的咖啡，从手腕上的针眼可以判断是因为他自己长期吸食，咖啡材料来自于他工作的大田制药会社。
三露知子家中发现的手枪上，检测出四井敏也的右手食指的指纹。那这两人在两个小时之后出现在奥穗町的树林的原因，很可能就和这件物品有关。
根据时间推算，从本美佑一的公寓到三露知子家中再到奥穗町的树林，两个小时的时间非常紧张。如果三露知子和四井敏也其中一人行凶后将枪支放在三露知子家中，再到树林的话，时间容不得任何停留。
林子现场存在第三个人，被害人头上被竹杖敲击产生的致命伤痕，与目暮十三协作的搜查九系将未出场、也联系不上的岸川英二列入重点对象。
但很快就被公安告知，岸川英二在上周五因涉嫌走私倒卖医用药物和危险品被公安追查，逃跑的过程中被炸死。
嫌疑人是岸川英二的可能性也被排除，警视厅的调查至此又陷入僵局，有警员甚至认为抢劫杀人也能说的通。
“我知道了。”工藤新一老弟打来的电话给目暮十三拓宽了思路。
与这家会社密切相关的还有两人，从始至终警方对于大田制药会社还有死亡高管的了解都是来自一位秘书的口中。
案发地点全部都不在大田制药，死亡人员却都是大田制药会社的高层。公安给出岸川英二倒卖药品和危险品的消息，指出大田制药内部的管理存有问题。
挂断电话，放下变声器的柯南来到了大田制药会社的门口。不实地调查，就不是在推理案件，而是在编小说。
昨天晚上思路有限，早起一回想，柯南就察觉出问题。
“那位秘书小姐待在会社的时间未免也太长了，是吧！”灰原哀又一次突然出现在柯南身后，刚才打给目暮警部的电话里也不知道让她听到多少内容。
柯南就全当她是天才儿童，昨天才死掉一个十岁就能改变世界的泽田弘树，那这个世界再多几个聪明点的一年级小学生也没什么大不了的。
哈依巴拉说的对，秘书告诉警方的内容中绝对有一部分并不是事实。
“岸川英二先生带着高层去伊豆旅游了，其他员工也放了假。”这是她原话，但是她又分好几次告诉警方上周五下午、上周末、这周一她都在会社整理东西。
然而目暮警部看到的却是她并没有整理出任何东西，访客登记表都找不到，员工信息表、库房记录要啥没啥，财务收支她又说是在本美佑一那里。
“那就好好查查会社里到地有什么吧。”柯南暂且将灰原看成小帮手。
因为严格意义上来说，死了四个高层的大田制药会社本身并没有涉案，警方也不方便随意搜证。所以等目暮十三将这个秘书传唤走，柯南就能进去调查，反正他私闯民宅也不是一次两次了。
柯南期望能找到的是麻醉药和肌松剂的药物的进出库记录，不管是正规的还是违法的，只要从事有关物品流通，必须得有便于管理的记录。
10分钟后。
“找到了……”灰原哀的声音从她刚拿到手的侦探徽章中传来。
柯南望了望周围，离得太远，猜不到灰原哀是在哪个方向，就继续用侦探徽章问，“你在哪里，哈依巴拉。”
灰原：“哈……”
隔空比划了两下，沟通完位置，柯南向灰原那里跑去。地点不在会社内，而是离会社大门不到50米的垃圾箱旁。
灰原：“如果那个秘书是犯人，那账本被一直呆在会社的她销毁是很合理吧。”
柯南看向垃圾箱旁边的标语，“嗯，她也没想到那么早就被怀疑，或者是她之前已经处理过了。”
标语是对垃圾的分类提示，可燃性垃圾回收日是每周三和周六，资源回收日是每周四，不可燃垃圾回收日是每月14和28日。
完整的纸张属于资源回收，但不可能冒着被人发现的风险，所以会被撕成碎片放在处理最快的可燃性垃圾回收处。
柯南顺着灰原哀最先翻出来的袋子，往里面看去，正是被撕成一片片的一堆文件残渣。这位秘书有点大意，可能不觉得警视厅能及时查到这里，竟然还是用手摇式碎纸机切碎的，这样产生的碎片对于有心想要复原的人来说没有任何难度。
简单地拼接之后，证据到手。违法贩卖医用危险品并不是岸川英二个人的事情，而是整个大田制药会社存在的问题。
将本美佑一、岸川英二、三露知子、四井敏也四人的案子并案调查，而大田制药会社与案件有关，自然不能够再抽身事外。
搜查三系对秘书的定位从知情人转为嫌疑人，而秘书在警方逼问下有另一套说辞。
本美佑一和岸川英二的事情再次咬死不知情，三露知子和四井敏也的事情声明她不是凶手。不同则是本美佑一死后，三露知子打电话让她出去，让她帮忙将一个没有密封的盒子送到三露知子的家里。
她在路上很好奇地打开了盒子，里面是一把还残留有硝烟气味的手枪。之后，她很生气很惊恐地给三露知子打电话，得到的回答却是“知道太多对你没好处”之类的话。
于是六神无主的她听从高级秘书三露知子的吩咐，小心地将枪放到三露知子家里，再回到会社销毁指定的文件，又因为害怕所以欺骗了来调查的警方。