就在太医院因为给皇上治病无良法而乱成一锅粥的时候，魏臣觉得拯救王叔和的机会来了，但是还不知道这小子到底有没有两把刷子，如果推荐他给皇上治病，带罪立功，或许皇上一高兴就可以免除王叔和的死罪，同时自己也想出面管理一下太医院，重点是要理顺太医院的体制，必须立下一些规矩，如此才能长治久安，他甚至突发奇想，能不能让王叔和进太医院，专门负责太医院的体制建设和规章制度的完善呢。于是便依计而行，魏臣命令廷尉提审王叔和，然后自己观阵，廷尉重复了原来的提问，王叔和也就不厌其烦地回答着曾经的不知道事情经过的供词，待告慰审累了，歇歇气的时候，魏臣盯着王叔和突然问道，“你对太医院有什么建议？”这纯属意料之外的问题，廷尉也不知道大臣肚子里要卖什么药，只能瞪着大眼望着魏臣，王叔和也感觉到一头雾水，原来以为既然大臣亲自来审案子就说明此案已经到了不可救药的地步，接下来自己也无可救药了，所以王叔和坦然地想好后事，不卑不亢地表达自己的见地：“太医院不应该是万能的，包揽百事，同时，太医院也不是万能的，包医百病。必须明确职能职责，我想太医院就应该有三种基本职责：其一是给皇上、皇宫及大臣、将军治病；其二是制药，制百药，预防、袪瘟疫、保健，兼以储备药材；其三是定药，制订药方，编辑药典，培训药工、医工。”
魏臣点了点头，于是试探性地问，“你当过军医、在地方行医，在百草堂坐诊，如果能在太医院锻炼一下，丰富你的阅历，肯定大有裨益。”
望着魏臣充满期待的脸，王叔和回答说，“我本来看淡功名利禄，是一个自由散漫的人，习惯于闲云野鹤，到了太医院恐怕难以守住信条，更难以遵从你们的规章制度，所以呢，还是留在军队里为好。”
“话虽然这么说，我也了解你的个性和为人，但是，天下医书都集中太医院，天下精良的设备都储存在这里，如果你想得到提升和修炼，就应该来试一试，这里有民间难得一见的奇书和万古流传的秘籍。”
王叔和听说有上古医书，还有秘籍药方后，心中一动，一念之间，情不自禁地说，“我的身份现在是军医。”
“军医也可以变为太医嘛。”
王叔和点了点头。
魏臣却慢条斯理起来，说，“这进太医院也不是我说了算，还得皇上点头同意，我还要揪准机会向皇上汇报，他一高兴你就可以今天进去，他一不高兴，也可能你永远进不去的，在这里也永远出不来，所以呢，你耐心等等，先处理好身边的琐事吧，一切听从我的安排，静候佳音。”
魏臣当然知道事情的先急后缓，第一件事就发布告通令全国，四处寻找良医；第二件事就是发动家皇宫内外献计献策；第三件事就是征集良药经方。赵将军提议让王叔和先到皇上面前露几手，试一试，如能上皇上刮目相看，那是最好不过的了，理由是王叔和曾经三次治好过皇后的病情，有一定的基础。魏臣觉得正中下怀，立即送王叔和进宫给皇上看病。
王叔和一听给皇上治病，心里就万分的紧张和千分的恐慌，昨天沦为阶下囚今天却成了皇上的坐上宾，这一时天上，一时地下的，刚才还在打雷闪电，转眼晴空万里，这翻云覆雨的行动让他极为不习惯，也不适应，左思右想，这太医院里高手如云，特别是像白术这样炙手可热的人如今也落得如此悲惨下场，我这个没有心机的人如何能胜任此项工作呢？为何不让太医院的太医来看病哟，他去询问魏棘，则说，那么不外乎两种情况，一种是皇上已经不信任太医院的医生了，第二种情况是太医院的医生治不好、拿不下来的必定病入膏肓。如果是第一种那还好说，如果属于第二种那就麻烦大大的了，试想，当今最高的医疗机构，高手云集，各科齐全，没有治不好病人，只有治不了的病，想到这里就有一些诚惶诚恐，不寒而栗。
太监将王叔和引导到皇上的病榻前，大厅里已经挤满了大臣和武将，还有太监宫女，叽叽喳喳，乱成了一锅粥。魏臣提醒王叔和，“必须镇定，再镇定。”王叔和点了点头，走近皇上，伸手把脉，先左手后右手，都感觉到脉象细而弱，且时有时无，飘忽不定；看一看皇上面色苍白，皮肤发黄，瞳孔扩散；观察舌头时，只见皇上嘴唇青紫、舌头发黑等症状。
王叔和退回到魏臣面前小声说，“皇上没有病。”
“没病？”魏臣简直不敢相信自己的耳朵，旁边闻言的几个大臣目瞪口呆，张大嘴巴望着王叔和，那意思很明显：你莫不是睁眼说瞎话吧。
“皇上只是中毒了，再加上日夜操劳，精疲力竭而矣。”
“什么？”魏臣更为惊奇，后者完全有可能，这事也不需要你说出来，大家都是明白人，也都能猜出一个八九分，日夜在东宫中操劳，能不精疲力竭？至于这中毒，有何解释？
据太医称，皇上在喝一种名叫长寿的仙丹，已经服用大半年了，都是炼丹大师白术所制。“这就是病的根源。”王叔和掷地有声的发言如同平地一声惊雷，响彻云霄，振聋发聩，大臣们太监们感到惊世骇俗，睁眼望着这个天不怕地不怕的犟人。王叔和也顾及不了那么多，他滔滔不绝地说，“这些仙丹配制时里面包含五金、三黄、乒石等40多味药物，分别列为上、中、下三品，‘上药令人身安、命延、升天、神仙，’其中丹砂被列为炼丹的上品第一，此物喝多了使人作渴，发热，烦躁，重症火眼，烧五脏，时间一长，五金相克，三黄相斗，必然产生毒素，集聚于体内，加些中毒。”
“现在咋办？”
“必须立即停药。”王叔和果断地提出自己的建议。
大臣开始嘀咕，“这药也该停止使用了，皇上曾经赐给我用过，喝一次药，兴奋一次，感觉到五脏六腑都在作渴，浑身上下，闷热难耐，烦躁不安。”
有老臣开玩笑说，“老臣喝后，曾经一夜三次。”
“先服用解毒药方。”王叔和建议立即配药，于是亮出自己的方子：“生地10钱， 麦冬10钱 ，伍味了10钱，川芎7钱 ，黄连3钱 ，当归10钱 ，甘草10钱。水煎服 一天一副 早晚各服一次。”
太医拿在手上一看，直接摇摇头，未置可否，其实内心可能感觉好笑，这就是众里寻他千百渡的药方？
“还有。”王叔和望着疑虑的魏臣说，“禁欲三十天。”
魏臣点了点头。禁欲？说得轻松，可这事让谁来监督呢。皇上真的已经到了不可救药的地步，说简单一点不是一日不近女色一日不能活命了。有了，让护卫来监督吧，魏臣招来东宫和西宫护卫，如此这般交待后，严厉地说，“你们是希望皇上活命呢，还是希望他累死？”大家异口同声地高呼，“吾皇万岁万万岁！”
“既然这样，大家就必须得听我的，从今天起连续三十天内，如果有谁让皇上踏进后宫半步，提着头来见我。”魏臣立下誓言，折断手中的佩玉，绕场一周，强调道，“粉身碎骨！”
“如果皇上要是硬闯呢？”大太监急了，他知道，如果皇上硬闯那是谁也拦不住的，到时候他进去了快活了，遭殃的肯定是太监而不是护卫，因为最后一道关口在太监哪里。
“迅速报告我。”魏臣不愿意再哆嗦了。
皇帝睡觉时，发现鼻子流血。经太医处置后止住了，也没当回事，第二天到晚上，鼻子又开始流血，太医处置后，不仅未止，反而加大出血量。这下慌了神，太医来了一群，马上报告魏臣，立即召见王叔和，迅速组织太医会诊，经过几个时辰的争论、讨论，王叔和最终拍板说，“皇上患的是风热鼻衄。”
“鼻衄证的致病原因很多，治法也各异，要因证而治。”王叔和说，“但是我可以肯定地告诉皇上，绝对不是喝了我前几天开的药方的原因。皇上勿忧，此疾乃小患也，为风热鼻衄。”
“何为风热鼻衄？”
“时下正春季，春季多风，风热之邪侵袭肺经，损伤阳络，使血溢于络外，则为衄血。《素问·金匮真言论》云：‘故春善渍鼻衄，阳络伤则血衄。”
皇上听后频频点头。太医看皇上点了头，也就不与论辩病因，就催着王叔和施治。
王叔和说：“风热血衄宜活瘀凉血、清热止血为要，臣用‘三黄泻心汤”’，方用黄连、黄芩、大黄活血化瘀，平阳敛阴，清热而散风邪。”
皇上有些不耐烦，说：“不要头头是道的，听不懂，快快给朕服药吧。”
在嘉福殿又待了六天，王叔和看着皇帝服药后，一帖止血，二帖轻身，三帖如常，心里的一块石头总算落了地。
王叔和顺便给贾贵妃看病了，贾贵妃吐泻多时，他拿出的治疗方案与太医院的治疗诊断方法不同，皇后厌食，不喜欢饮水，且长期肠鸣腹泻，咳喘不减，精神萎靡。推断贾贵妃脾肾阳虚，不能运化所致，宜用师父的“理中汤”，乃干姜、人参、茯苓、白术、干草制成。太医们用的是泻方，他则用补方。
太后胸痛似蚁啃，又似针扎，王叔和断定为热夹杂湿症，原因是年轻时暑身热汗时喜欢冷巾敷之所致，系风、湿合参，久而久之即成风湿胸痹，三四月间发病，此时阳气复生，湿风渐起，若遇发物热身即发。五帖“麻贲杏仁薏苡仁汤”，加以艾炙炙之，加上针炙，立即就好了。
皇后奖蜀锦、皇帝授予“医圣”牌匾。
回到客舍，王叔和向魏臣告别了，回家是倒头便睡，睡了一天一夜方才解困。